1、相比锂电池，氢燃料电池能量密度更高，可实现续航能力更强。以丰田第二代Mirai为例，3个储氢罐可携带液氢5.6KG，最高续航里程可达850公里；
2、相比锂电池充电几小时，即便是快充半小时可充至60%，氢燃料电池车补能仅需3-5分钟，像公车等大型车辆，15分钟也可完成补能，氢燃料电池使用更灵活；
3、锂电池对环境还是存在一定污染的，而氢燃料电池的则更加环保，电池堆反应只会产生水和电流，不过氢燃料电池汽车也是需要搭载储能电池的；
4、氢燃料电池造价更高，更加复杂的动力系统，外加需要使用铂金作为催化剂，该催化剂对氢气的纯度要求高，制氢成本高，每公斤的氢气耗费50度电（在纯电动汽车上可实现最高400公里续航），总制氢成本近40元/公斤。加氢站投资成本高，单座投资需1200至1800万元。
氢电池为什么普及不了的另一个重要原因是氢能源专利被日本企业垄断，全球83%的专利均在日企手上。目前，国家并未放弃氢燃料电池，按规划，氢燃料电池将更多的应用在中重型车辆、大巴、卡车等新能源客货车辆，以及船舶、航空器等领域。
